尊龙凯时

lncRNA

  • 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
  • 技術(shù)流程
  • 樣本要求
  • FAQ

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA是長(zhǎng)度大于 200 個(gè)核苷酸的非編碼 RNA,位于細(xì)胞核或胞質(zhì)內(nèi)。lncRNA起初被認(rèn)為轉(zhuǎn)錄的“噪音”,而后越來越多的研究表明,lncRNA 在眾多生命活動(dòng)過程中發(fā)揮重要作用,lncRNA因此引起人們廣泛的關(guān)注。lncRNA測(cè)序技術(shù)也隨之廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)調(diào)控、物種進(jìn)化、物質(zhì)代謝以及環(huán)境抗逆等研究。

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
  • 經(jīng)驗(yàn)豐富
    提取成功率85%+,建庫成功率95%+,物種覆蓋多,項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)2,000+
  • 實(shí)驗(yàn)技術(shù)成熟
    采用官方建庫試劑盒,rRNA殘留率<10%,且穩(wěn)定
  • 專業(yè)的實(shí)驗(yàn)/分析團(tuán)隊(duì)
    實(shí)驗(yàn)/分析團(tuán)隊(duì)經(jīng)驗(yàn)豐富,其中生信人員平均專注轉(zhuǎn)錄調(diào)控領(lǐng)域5年+
  • 一站式服務(wù)
    售前方案設(shè)計(jì),售中異常解決,售后個(gè)性化分析,多方位服務(wù)
產(chǎn)品特點(diǎn)
  • 可預(yù)測(cè)新的lncRNA
    既可鑒定已知的lncRNA,又可以預(yù)測(cè)新的lncRNA
  • 組學(xué)分析
    lncRNA+mRNA、lncRNA+miRNA、全轉(zhuǎn)錄組、lncRNA+表觀等
  • 三位一體
    三位一體的轉(zhuǎn)錄組分析解決方案(lncRNA-mRNA-circRNA)
應(yīng)用領(lǐng)域
  • 環(huán)境脅迫
  • 轉(zhuǎn)錄調(diào)控
  • 分子標(biāo)記
  • 生長(zhǎng)發(fā)育等


產(chǎn)品類型測(cè)序平臺(tái)及策略推薦數(shù)據(jù)量數(shù)據(jù)質(zhì)量
去核糖體鏈特異性文庫

二代測(cè)序 PE150

≥12 GQ30≥85%

產(chǎn)品類型樣品要求
lncRNA樣品需求量

動(dòng)物樣品:≥0.5 μg

植物葉片、莖類樣品≥0.5 μg

樣品濃度

動(dòng)物樣品:≥60 ng/μl

植物葉片、莖類樣品≥30 ng/μl

樣品純度
OD260/280=1.8~2.2
RNA完整性

植物樣品RIN≥5.5

動(dòng)物樣品RIN≥5.8

   
  • Q:什么是長(zhǎng)鏈非編碼RNA?以及它們的作用?
    A:
    哺乳動(dòng)物基因組序列中約5%~10%被穩(wěn)定轉(zhuǎn)錄,蛋白質(zhì)編碼基因僅約占1%,其余4%~9%的序列都轉(zhuǎn)錄為非編碼RNA。而非編碼RNA(non-coding RNA)是指不能翻譯為蛋白的功能性RNA分子。長(zhǎng)鏈非編碼RNA為這4%~9%中長(zhǎng)度大于200 nt的非編碼RNA。它們的作用主要體現(xiàn)在四個(gè)方面:第一,影響周邊基因的表達(dá);第二,調(diào)控蛋白質(zhì)活動(dòng)及定位;第三,產(chǎn)生小分子RNA;第四,對(duì)其他RNA的調(diào)控作用。

  • Q:rRNA的去除方法有哪些?
    A:
    有些long non-coding RNA有polyA尾,有些沒有,為了保證能夠獲得所有l(wèi)ong non-coding RNA,就不能用oligodT標(biāo)記磁珠進(jìn)行富集,只能用去rRNA試劑盒去除核糖體RNA。不同物種rRNA去除效果跟試劑盒中所使用探針的匹配程度有很大相關(guān),如果去除效果不好,需要加大測(cè)序數(shù)據(jù)量達(dá)到相應(yīng)的clean data。

  • Q:long non-coding RNA為什么構(gòu)建鏈特異性文庫?
    A:
    很多基因組區(qū)域具有正負(fù)鏈的轉(zhuǎn)錄本,反義轉(zhuǎn)錄是真核基因的一個(gè)特征,是一種重要的調(diào)控方式。使用ssRNA-Seq(Strand-Specific)能夠保留RNA的方向性信息,可以確定轉(zhuǎn)錄本來自正鏈還是負(fù)鏈,以便更加準(zhǔn)確的獲得基因的結(jié)構(gòu)以及基因表達(dá)信息。
97少妇无码视频在线播放_日韩熟妇啪啪无码视频_永久免费av网址_小小bbwxxxx