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10x Genomics單細胞蛋白質(zhì)組測序

  • 產(chǎn)品簡介
  • 樣本要求
  • FAQ

在10x單細胞轉(zhuǎn)錄組的基礎(chǔ)上,利用10x Feature Barcoding技術(shù)和Biolegend設(shè)計的帶有特異核酸序列的免疫組抗體(TotalSeq產(chǎn)品),可以同時獲得大量單個細胞中基因的表達量和細胞表面蛋白的表達情況。在已知細胞表面標志性蛋白時,采用上述技術(shù)加入相應(yīng)抗體,能幫助我們更準確的對細胞進行功能研究。

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圖1 Feature Barcoding技術(shù)結(jié)合TotalSeq抗體捕獲細胞表面蛋白原理圖

上圖左邊為BioLegend公司推出的TotalSeq系列抗體,每個抗體鏈接著一段設(shè)計好的核酸序列,序列上有每種抗體獨有的15 bp的barcode序列,通過抗原抗體特異性結(jié)合,帶有核酸序列的抗體會和細胞表面特定蛋白結(jié)合。之后通過右圖所示10x Genomics Feature Barcode技術(shù),可以捕獲到抗體所帶核酸序列,并通過UMI的數(shù)量,間接得到特定細胞表面蛋白的表達量。實現(xiàn)了一套樣品進行實驗處理和信息分析,可同時得到基因表達信息和表面蛋白表達信息。

   

樣品要求
樣本類型新鮮細胞懸浮液、細胞凍存液
樣本總量總量>1.5*106(一般1*106個細胞對應(yīng)抗體-核酸使用量為1 μg,另0.5*106個細胞用于細胞計數(shù)和活性檢測)
樣本濃度請與現(xiàn)場實驗人員協(xié)商調(diào)節(jié)濃度的方案
樣本質(zhì)量

樣本中活性大于85%,無大于40 μm的細胞碎片、組織碎片、纖維灰塵等各類雜質(zhì),總雜質(zhì)含量經(jīng)估算應(yīng)<5%

細胞呈單分散狀態(tài),細胞結(jié)團率<5%

細胞懸浮液中不含逆轉(zhuǎn)錄抑制劑成分,不含游離核酸
   
  • Q:10x Genomics單細胞表面蛋白研究策略?
    A:
    目前我司提供兩種研究策略
    1. 10x Genomics 3'單細胞轉(zhuǎn)錄組+表面蛋白文庫;
    2. 10x Genomics 5'單細胞轉(zhuǎn)錄組+TCR/BCR+表面蛋白文庫,每個轉(zhuǎn)錄組文庫推薦測60-100k reads,每個TCR/BCR/表面蛋白文庫推薦測6-10k reads/cell。
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